Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkdcP97313 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkdcP97313 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkdcP97313 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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