Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nucb2P81117 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms