Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sparcl1P70663 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms