Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tp53bp1P70399 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tp53bp1P70399 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms