Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdlim4P70271 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdlim4P70271 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdlim4P70271 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms