Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkn1P70268 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkn1P70268 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkn1P70268 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms