Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkcbP68404 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms