Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actg1P63260 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg1P63260 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg1P63260 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actg1P63260 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms