Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcsk1P63239 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcsk1P63239 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk1P63239 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms