Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl8P62918 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl8P62918 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl8P62918 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl8P62918 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl8P62918 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl8P62918 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl8P62918 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms