Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra1P62812 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra1P62812 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra1P62812 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms