Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrpd3P62320 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd3P62320 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms