Protein–RNA interactions for Protein: P62242

Rps8, 40S ribosomal protein S8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps8P62242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps8P62242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps8P62242 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps8P62242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps8P62242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps8P62242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms