Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan5P62080 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tspan5P62080 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms