Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnnP61807 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnnP61807 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnnP61807 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnnP61807 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnnP61807 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnnP61807 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnnP61807 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnnP61807 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnnP61807 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnnP61807 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnnP61807 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnnP61807 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnnP61807 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnnP61807 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnnP61807 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnnP61807 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnnP61807 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnnP61807 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnnP61807 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms