Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf13P61216 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf13P61216 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf13P61216 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms