Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ActbP60710 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ActbP60710 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ActbP60710 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ActbP60710 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ActbP60710 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ActbP60710 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ActbP60710 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ActbP60710 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ActbP60710 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ActbP60710 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ActbP60710 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ActbP60710 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ActbP60710 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ActbP60710 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms