Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppfia3P60469 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia3P60469 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppfia3P60469 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms