Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b6P59708 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms