Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Anks1aP59672 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Anks1aP59672 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Anks1aP59672 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms