Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fermt1P59113 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fermt1P59113 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fermt1P59113 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fermt1P59113 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fermt1P59113 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fermt1P59113 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fermt1P59113 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms