Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps33bP59016 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33bP59016 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33bP59016 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms