Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctbp2P56546 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctbp2P56546 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctbp2P56546 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms