Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defb1P56386 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defb1P56386 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Defb1P56386 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb1P56386 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms