Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Acod1P54987 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms