Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb4P54761 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb4P54761 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms