Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Faf1P54731 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Faf1P54731 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Faf1P54731 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms