Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PctpP53808 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PctpP53808 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PctpP53808 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PctpP53808 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PctpP53808 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PctpP53808 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PctpP53808 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PctpP53808 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PctpP53808 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PctpP53808 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PctpP53808 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PctpP53808 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PctpP53808 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PctpP53808 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PctpP53808 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PctpP53808 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PctpP53808 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PctpP53808 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PctpP53808 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms