Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RabggtbP53612 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtbP53612 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtbP53612 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms