Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dbx1P52950 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dbx1P52950 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dbx1P52950 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.7 ms