Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efnb1P52795 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efnb1P52795 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms