Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SqleP52019 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SqleP52019 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SqleP52019 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SqleP52019 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SqleP52019 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SqleP52019 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SqleP52019 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SqleP52019 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SqleP52019 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SqleP52019 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SqleP52019 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SqleP52019 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SqleP52019 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SqleP52019 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SqleP52019 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SqleP52019 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SqleP52019 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SqleP52019 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SqleP52019 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SqleP52019 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SqleP52019 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms