Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcn3P51791 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcn3P51791 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms