Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LtbrP50284 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LtbrP50284 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LtbrP50284 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LtbrP50284 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LtbrP50284 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms