Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hcls1P49710 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hcls1P49710 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcls1P49710 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms