Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb42P49222 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb42P49222 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epb42P49222 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epb42P49222 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms