Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbp3P49194 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbp3P49194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms