Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptx3P48759 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx3P48759 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms