Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LmnaP48678 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LmnaP48678 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LmnaP48678 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LmnaP48678 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LmnaP48678 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LmnaP48678 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LmnaP48678 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LmnaP48678 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LmnaP48678 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LmnaP48678 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LmnaP48678 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LmnaP48678 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms