Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GdnfP48540 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GdnfP48540 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms