Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx1P48377 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx1P48377 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms