Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VdrP48281 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VdrP48281 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VdrP48281 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VdrP48281 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VdrP48281 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VdrP48281 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VdrP48281 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VdrP48281 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VdrP48281 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VdrP48281 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VdrP48281 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VdrP48281 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VdrP48281 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VdrP48281 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VdrP48281 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VdrP48281 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VdrP48281 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VdrP48281 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms