Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl13P47963 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl13P47963 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl13P47963 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl13P47963 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms