Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CratP47934 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CratP47934 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CratP47934 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CratP47934 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CratP47934 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CratP47934 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CratP47934 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CratP47934 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CratP47934 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CratP47934 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CratP47934 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CratP47934 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CratP47934 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CratP47934 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CratP47934 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CratP47934 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CratP47934 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms