Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gli1P47806 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gli1P47806 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gli1P47806 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gli1P47806 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gli1P47806 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli1P47806 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms