Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc2P43407 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sdc2P43407 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms