Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3caP42337 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3caP42337 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3caP42337 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms