Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sept1P42209 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sept1P42209 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sept1P42209 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms