Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ThpoP40226 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ThpoP40226 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ThpoP40226 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ThpoP40226 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms