Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Timp3P39876 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Timp3P39876 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timp3P39876 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms